年間「10万円」超の医療費があるけど、「確定申告」が面倒すぎる…。マイナ保険証があると「医療費控除の提出書類」はどのくらい省略できますか？

配信日: 2026.01.16

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年間「10万円」超の医療費があるけど、「確定申告」が面倒すぎる…。マイナ保険証があると「医療費控除の提出書類」はどのくらい省略できますか？

医療費控除のために領収書を集めたり、明細を入力したりする手間を面倒だと感じている方は少なくありません。そんな中「マイナ保険証があれば医療費控除がラクになるらしい」という話を聞いたことがある方もいるでしょう。

本記事では、マイナ保険証とマイナポータル連携を利用した場合に、医療費控除の明細作成・入力の手間がどれくらい減るのか、従来どおり自分で入力が必要なケース、マイナンバーカードで申告する流れについて解説します。

マイナ保険証でどのくらい確定申告が楽になるか知りたい方は、ぜひ参考にしてください。

執筆者 : FINANCIAL FIELD編集部 ▼

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1 マイナ保険証があると医療費控除の手間は減る？
2 マイナ保険証でも従来通りの対応が必要なケース
3 マイナンバーカードで医療費控除を申告する流れ
4 マイナ保険証があると医療費控除の明細作成・入力の手間が省力化できる

マイナ保険証があると医療費控除の手間は減る？

これまで医療費控除を受けるには、病院や薬局でもらった領収書を保管しつつ、医療費控除の明細書を自分で作成する必要がありました。この作業を面倒と感じている方は少なくないでしょう。

そこで役立つのがマイナ保険証です。マイナポータルと連携することで、医療費控除に使える情報を自動で取得でき、確定申告書等作成コーナーの医療費控除の明細入力欄に反映されます。これにより、医療費の入力作業や計算の手間が大幅に減ります。

マイナ保険証でも従来通りの対応が必要なケース

マイナ保険証があると医療費控除の手間は減りますが、すべての医療費が自動で反映されるわけではありません。マイナポータルで確認できるのは、医療機関等で保険診療を受けた場合に限られます。

例えば、以下のような費用は自分で入力・調整する必要があります。

・ドラッグストアで購入した市販薬
・高額療養費として後日払い戻される分（補填分の差し引き調整）
・立て替え払いをした医療費（保険証を忘れた場合など）
・はり・きゅう、あん摩マッサージ指圧の施術費
・整骨院・接骨院での施術費
・自由診療や差額ベッド代など保険適用外の費用

これらは自動で反映されないため、自分で金額を把握し、領収書を保管するようにしましょう。

マイナンバーカードで医療費控除を申告する流れ

マイナンバーカードを使えば、医療費控除の手続きの手間は減ります。ただし、事前準備や操作の流れを知らないと戸惑いやすいため、全体の流れを把握しておきましょう。

マイナンバーカードで医療費控除を申告する流れは、以下の通りです。

1．マイナンバーカードを用意する
2．スマートフォン、またはパソコンとICカードリーダライタを準備する
3．利用者証明用電子証明書（数字4桁）を確認する
4．署名用電子証明書（英数字6〜16桁）を確認する
5．国税庁の「確定申告書等作成コーナー」にアクセスする
6．「作成開始」から申告する年分と申告書の種類を選ぶ
7．マイナンバーカードを使ってマイナポータルにログインする
8．スマートフォン、またはICカードリーダライタでカードを読み取る
9．マイナポータル連携を選び、医療費通知情報の取得設定を行う
10．家族分の医療費がある場合は、あわせて取得する（※取得にはマイナポータルで代理人設定が必要）
11．医療費データが自動で反映される
12．内容を確認し、保険金などで補填された金額があれば修正する
13．自由診療や市販薬、通院時の交通費などは手入力で追加する
14．すべての内容を確認し、申告を完了する

確定申告の負担を減らしたい方は、ぜひ活用してみてください。

マイナ保険証があると医療費控除の明細作成・入力の手間が省力化できる

マイナ保険証とマイナポータル連携を利用すれば、医療機関などで支払った保険診療分の医療費について、マイナポータル連携で取得した医療費通知情報を確定申告書等作成コーナーに自動入力できるため、手入力や計算の手間を大きく減らせるのが大きなメリットです。

ただし、すべての医療費が自動で反映されるわけではありません。市販薬の購入費や通院時の交通費、自由診療などは、これまで通り自分で管理・入力する必要があります。

すべて省略できるわけではないものの、活用すれば確定申告の負担は軽減されます。医療費が10万円を超える年や、通院回数が多い方ほど効果を実感しやすいでしょう。

確定申告の時期になって慌てないためにも、早めにマイナンバーカードの準備や設定を確認しておくことをおすすめします。